Для МРТ шеи пациент ложится на стол-платформу, где голова фиксируется. По необходимости, вводится контрастное вещество. Стол подвозится к сканеру, останавливаясь на уровне исследуемой зоны. Томограф производит снимки, передаваемые на монитор компьютера. Процедура длится 20 минут (без контраста) или до 30 минут (с контрастом).