Сергій Юрійович в період з 1994 по 2000 рр. займався науковою роботою на базі відділення аритмій серця при Інституті кардіології ім. М.Д. Стражеска. У 1996 р. відбувся захист кандидатської дисертації доктора Зотова, в якій розкривалися проблеми порушень ритму серця при синдромах преекситації. З 2005 р. доктор Зотов консультує в кардіологічній клініці "Серце і судини".